机甲兽神第一部ポケモンリーグでチャンピオンになることをゆめ見る少女・ツボミ。　　ポケモンといっしょに旅に出たいとママにおねがいしているが、なかなかゆるしてもらえない。　　ある日、いよいよがまんできなくなり「ひとりで旅に出てやる！」と決意したツボミは、ポケモンをつかまえに近くの森の中へ。　　そこで出会ったのは……!?