怪兽档案第二季根据天下霸唱同名小说改编，讲述了20世纪80年代末，北京少年张保庆为给恩师寻药，只身前往东北鹰屯，却因偶得一张古老的地图，与地质少年团开启了共同探秘天坑的故事。探险途中，少年不惧危险，勇挫贪婪势力，深刻领悟到人类的过度贪婪终将破坏大自然的平衡，逐渐从懵懂的毛头小子成长为有责任感的英雄少年的故事。